Ketua Majelis Pembimbing Nasional dari Masa ke Masa
| 1945-1967 | Dr. (H.C.) Ir. H. Soekarno |
| 1967-1998 | Jenderal Besar TNI (Purn.) H. M. Soeharto |
| 1998-1999 | Prof. Dr. Ir. H. Bacharuddin Jusuf Habibie, FREng |
| 1999-2001 | Dr. (H.C.) K. H. Abdurrahman Wahid |
| 2001-2004 | Prof. Dr. (H.C.) Hj. Diah Permata Megawati Setiawati Soekarnoputri |
| 2004-2014 | Jenderal TNI (HOR) (Purn.) Prof. Dr. Dr. (HC). H. Susilo Bambang Yudhoyono, M.A. |
| 2014-sekarang | Ir. H. Joko Widodo |
Ketua Kwartir Nasional dari Masa ke Masa
| 1961–1974 | Sri Sultan Hamengkubuwono IX |
| 1974–1978 | Letjen. M. Sarbini |
| 1978–1993 | Letjen. Mashudi |
| 1993–1998 | Letjen. Himawan Soetanto |
| 1998–2003 | Letjen. Rivai Harahap |
| 2003–2013 | Prof. Dr. Azrul Azwar, MPH |
| 2013–2018 | Dr. H. Adhyaksa Dault, S.H., M.Si. |
| 2018–2023 | Komjen. Pol (Purn) Drs. Budi Waseso |
Ketua Kwartir Daerah Maluku dari Masa ke Masa
| 1961-1964 | dr. Wem Tehupeiory |
| 1964-1977 | Letkol Laut (P) Samsul Bahri |
| 1977-1984 | D. D. Soumokil |
| 1984-1988 | Syauta |
| 1988-1994 | M. W. Siahaya |
| 1994-1996 | Z. Soafasihu |
| 1996-1997 | Drs. M. H. A. Tuarita |
| 1997-1998 | Drs. Abubakar |
| 1998-1999 | Kombes Pol. Andi Sarifudin |
| 1999-2004 | Brigjen Pol. Dra. Paula B. Renyaan |
| 2004-2009 | Drs. M. A. Latuconsina, M.Si |
| 2009–2014 | Ir. Said Assagaf |
| 2014–2019 | Drs. Jacob Patty |
| 2020–2025 | Widya Pratiwi Murad |
Ketua Kwartir Cabang Buru dari Masa ke Masa
| 2013–2015 | Ir. Juhana Soedrajat |
| 2015–2020 | Drs. Ahmad Assagaf, M.Si |
| 2022–2027 | Najib Hentihu, SP. M.Si |